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CompuCell3D 3.7.6 Revision 20170723

CompuCell3D - Eine effiziente und unkomplizierte Software, die Ihnen zugeschnitten ist, um Ihnen bei der Visualisierung und Gestaltung fortschrittlicher 3D-Molekülmodelle zu helfen

Eine effiziente und unkomplizierte Software, die Ihnen zugeschnitten ist, um Ihnen bei der Visualisierung und Gestaltung fortschrittlicher 3D-Molekülmodelle zu helfen

Die molekulare Modellierung ist ein faszinierender wissenschaftlicher Vorstoß in die Tiefen des menschlichen Organismus, der wichtige Antworten auf einige unserer grundlegendsten Fragen liefern kann. Glücklicherweise haben die Wissenschaftler stark von der stetigen Zunahme der Rechenleistung profitiert, da immer mehr Anwendungen dazu beitragen, ihnen zu helfen, biologische Mysterien zu entschlüsseln. CompuCell3D ist nur ein solches Programm, das von hochqualifizierten Fachleuten eingesetzt werden kann, um das Zellverhalten genau zu simulieren und zu modellieren.

Der wissenschaftliche Nutzen nutzt zelluläre Potts-Modelle, speziell Glazier-Graner-Hogeweg (GGH) -Algorithmen, um das Verhalten von Einzel- oder Mehrzellen-Geweben, Organen oder Organismen zu modellieren und zu beschreiben. Dieser Gitter-basierte Ansatz stellt sicher, dass Modelle exakt lösbar sind und generierte Simulationen und Zelldarstellungen adäquat bis zu den eigentlichen Mechanismen skalieren.

Das Erstellen einer Simulation erfordert, dass Benutzer die eigentlichen Zellen definieren und ihre Interaktionen entwerfen. Dies geschieht durch das Setzen neuer Eigenschaften auf die Einträge im "Modell-Editor". Genau wie bei jeder Programmierumgebung können Wissenschaftler alle Eigenschaften der Simulationselemente, einschließlich der physischen Dimensionen, Volumina und Zelltypen, anpassen.

Für eine lebensfähige Forschung muss man auch die Amplitude der Fluktuationen und den Grad der Variation definieren. Die Anfangskonfiguration der Zellen muss ebenfalls definiert werden und Benutzer können diese letzteren Elemente aus beliebigen einfachen Dateien importieren. Nachdem alle diese Schritte abgeschlossen sind, erfolgt die Simulation durch einfaches Klicken auf die Schaltfläche "Ausführen".

Allerdings finden mehr tech-versierte Benutzer die Anwendung der Unterstützung für Python-Skripte und C ++ - Erweiterungen sehr wertvoll, da es ermöglicht, um anspruchsvollere und genaue biologische Modelle zu bauen. Während der Simulation können Screenshots aufgenommen werden und man kann auch PIF-Dateien aus den VTK-Ausgängen erzeugen.

Alles in allem ist CompuCell3D eine leistungsstarke Lösung für alle, die auf dem Gebiet der biologischen Modellierung auf der Zellebene tätig sind. Der GGH-Algorithmus wird verwendet, um einzelne oder mehrzellige Gewebe oder Organismen genau zu modellieren und fortgeschrittene Benutzer können auch Python-Skripte einfügen, um verbesserte Analysen zu erzeugen.

CompuCell3D Informationen

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